客製化購物網站相比一些現成模組或半客製方案，需要較多的網站建置時間，因為會以當下較新的程式語言以及寫法去重新建置，從設計到程式都是從零到有，每個環節從視覺的設計到網頁設計切版，接著開發對應頁面的功能與程式與系統分析，通常都需要4-6個月以上的建置期，相對人力成本也比半客製或是現成套版高出很多。

當然，100% 的客製網站具有一定的優勢，因為是針對客戶需求量身訂做，功能面也都是客戶端需要的，更能符合客戶端的需求。除此之外，針對當下新的語法去處理的程式，也會去考量新的趨勢與一些技術性與安全性的問題，整體的程式安全性也會比較高。